刘开强¹ , 崔中秋² , 李军玲 ² , 孙玥² , 苏京平² , 王胜军² , 高菊¹ , 张嘉楠³ , 闫双勇 ²

1 广西壮族自治区农业科学院, 广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室, 南宁, 530007; 2 天津市农业科学院农作物研究所, 天津, 300112;3 石家庄博瑞迪生物技术有限公司, 石家庄, 050035
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《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20 卷, 第 19 篇   
收稿日期: 2022年01月11日    接受日期: 2022年01月21日    发表日期: 2023年02月08日

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株高是和水稻高产、稳产密切相关的重要农艺性状，发掘可育种利用的矮秆基因有重要的应用价值。本研究利用育种残余杂合系，鉴定了一个显性矮秆基因 sd9，该基因能将株高降低 18 cm。近等基因系 F2群体的遗传学分析显示矮秆植株与高秆植株的分离比为 3:1，表明 sd9 为显性矮秆基因。构建了极高单株和极矮单株两个极端表型 DNA 混合池。利用靶向测序基因型检测(genotyping by target sequencing, GBTS)和40 k 水稻 SNP 检测液相芯片相结合的方法进行了 DNA 混合池的基因型鉴定，将 sd9 基因定位于第 9 染色体 14 976 197~14 993 586 bp 区间。根据该区间的 SNP 开发了 sd9 连锁的 KASP 标记，验证了定位结果。分子标记的单因素方差分析显示：区间内的分子标记和株高极显著相关。单个标记 QTL 检测 LOD 值为 57.50，解释表型效应66.50%。利用育种残余杂合系鉴定的 sd9 及其 KASP 标记的开发，可以为水稻株型的分子育种提供可直接利用的基因资源。

水稻；显性矮秆基因；育种残余杂合系；定位；靶向测序基因型检测